Plastide
Nature Plantes (2023)Citer cet article
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La toxicité de l'ammonium affectant le métabolisme et le développement des plantes est un problème mondial qui entrave la production agricole. Il est remarquable que le riz (Oryza sativa L.) privilégie l’ammonium comme principale source d’azote dans les rizières. Nous avons mis en place un criblage génétique avancé pour déchiffrer les mécanismes moléculaires conférant une tolérance à l'ammonium au riz et identifié le rohan présentant une hypersensibilité des racines à l'ammonium en raison d'une mutation faux-sens dans un gène codant pour l'argininosuccinate lyase (ASL). L'ASL se localise dans les plastes et son expression est induite par l'ammonium. L'ASL atténue l'élongation des racines inhibée par l'ammonium en convertissant l'excès de glutamine en arginine. Par conséquent, l’arginine conduit à une accumulation d’auxine dans le méristème de la racine, stimulant ainsi l’élongation des racines sous une teneur élevée en ammonium. De plus, nous avons identifié une variation naturelle de l'allèle ASL entre les sous-espèces japonica et indica, expliquant la sensibilité différente de leurs racines à l'ammonium. Enfin, nous montrons que l’expression de l’ASL est positivement corrélée à la tolérance à l’ammonium des racines et que l’efficacité et le rendement de l’utilisation de l’azote peuvent être améliorés grâce à une approche de gain de fonction.
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Les ensembles de données bruts de séquençage du génome entier (WGS) et les ensembles de données RNA-seq ont été déposés sur NCBI BioProject (//www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject) sous les numéros d'accès PRJNA808438 et PRJNA808101. Les ensembles de données de métabolomique largement ciblées sont déposés à l'OMIX, China Center for Bioinformation/Beijing Institute of Genomics, Chinese Academy of Sciences sous le numéro d'accès OMIX004476 (https://ngdc.cncb.ac.cn/omix), et sont également disponibles. dans le tableau supplémentaire 1. Les données sources sont fournies avec ce document. Pour tous les ensembles de données non disponibles via les liens ci-dessus, ils peuvent être demandés auprès de l'auteur correspondant.
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